#NuevaPublicación. DNA barcodes highlight genetic diversity patterns in rodents from lowland desert and Andean areas in Argentina

La Dra. Agustina Novillo, junto a otrxs prestigiosxs investigadorxs acaban de publicar un articulo sobre DNA barcode y roedores de Argentina.

"Los códigos de barras de ADN resaltan patrones de diversidad genética en roedores del desierto de tierras bajas y áreas andinas en Argentina"

Les dejamos un resumen y el link

Resumen

Los roedores son un componente importante de la fauna de América del Sur. Su gran diversidad ha motivado a los investigadores a revisar continuamente su taxonomía, diversidad genética, límites de especies y relaciones filogenéticas. Aquí, aplicamos el uso de códigos de barras genéticos para evaluar la diversidad taxonómica y genética de los dos principales linajes de roedores sudamericanos: caviomorfos y sigmodontinos. Analizamos 335 códigos de barras del gen mitocondrial Citocromo Oxidasa I (COI) en 34 especies determinadas morfológicamente de 39 localidades a lo largo de los Andes centrales y tierras áridas de Argentina. La unión de vecinos (Neighbor joining) y la reconstrucción de máxima verosimilitud proporcionaron una clara separación entre las especies. El numero índice de los códigos de barras (BIN por sus siglas en ingles) y árbol de delimitación de especies Poisson bayesiano (bPTP) se utilizaron para confirmar la concordancia entre los grupos de secuencias y las designaciones de especies por taxonomía. Encontramos una profunda divergencia dentro del complejo de especies de Phyllotis xanthopygus, con distancias de hasta 13.0% entre linajes separados geográficamente. Se encontraron divergencias menores (3.30% y 2.52%) dentro de Abrothrix hirta y Tympanoctomys barrerae, respectivamente, con diferenciación en sus linajes genéticos. Además, documentamos grupos separados geográficamente para Akodon spegazzinii y A. oenos con una divergencia de hasta el 2.3 %, pero los métodos de agrupación por clusters no lograron distinguirlos como especies diferentes. Los resultados de las secuencias muestran una brecha clara en el código de barras con una divergencia intraespecífica media (0.56 %) versus una mínima promedio al vecino más cercano (neighbor joining de (10.1 %). Las distancias entre especies congenéricas variaron de 4.1 a 14%, con la excepción de dos formas relacionadas dentro de Euneomys y las especies hermanas Akodon spegazzinii y A. oenos. Este estudio constituye una contribución sustancial a la biblioteca de referencia global de códigos de barras. Proporciona información sobre patrones filogeográficos complejos y escenarios de especiación en roedores, al tiempo que destaca las áreas que requieren una investigación desde la taxonomía integrativa en profundidad.

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Ojeda, A. A., Novillo, A., Lanzone, C., Rodríguez, D., Cuevas, M. F., Jayat, J. P., ... 
& Borisenko, A. (2022). DNA barcodes highlight genetic diversity patterns in rodents 
from lowland desert and andean areas in argentina. Molecular Ecology Resources.